目前最常用的核酸检测方法，通过反转录酶将病毒RNA转为cDNA，再经荧光定量PCR扩增特定片段检测病毒核酸。其优势在于灵敏度高（可检测低至几个病毒拷贝）、特异性强，但需专业设备及人员操作。
包括环介导等温扩增（LAMP）、恒温荧光扩增等技术，在恒定温度下完成核酸扩增，无需复杂仪器。例如LAMP技术通过特定引物实现高效扩增，适用于基层医疗机构或现场快速检测，但灵敏度略低于RT-PCR。
通过全基因组或靶向测序分析病毒序列，用于病毒溯源、变异监测等研究场景。Sanger测序和下一代测序（NGS）可精确识别病毒基因特征，但成本较高且需专业设备。
利用Cas蛋白识别并切割特定病毒核酸序列，通过检测切割活性判断感染。该技术特异性强且灵敏度高，但目前多处于研究阶段，尚未大规模临床应用。
不同技术需根据检测目的、资源条件及人群特点选择，同时采样规范性和操作流程直接影响结果准确性。
