核酸检测中常用的染料颜色主要取决于染料的类型及其与核酸结合后的荧光特性。以下为常见染料的颜色特征分类:
溴化乙锭(EB)及其替代品
溴化乙锭(EB):结合DNA后紫外激发下呈现橘红色荧光。
GelRed/GelGreen:与EB光谱相似,GelRed显红色,GelGreen显绿色,均无需脱色且稳定性高。
SYBR系列染料
SYBR Green I:结合双链DNA后发射绿色荧光(最大发射波长520nm),常用于qPCR定量。
SYBR Gold:灵敏度更高,荧光信号增强超1000倍,适用于低浓度检测。
GoldView系列染料
GoldView I/II型:双链DNA显绿色,单链DNA显红色,但荧光易淬灭(5-10分钟内消失)。
其他特殊染料
EvaGreen:低毒性,稳定性高(耐高温),适用于熔解曲线分析,荧光颜色为绿色。
LC Green PLUS:专为高GC含量DNA设计,荧光特性适合高分辨率熔解曲线。
传统非荧光染料
甲基绿:高度聚合DNA染绿色,解聚DNA和RNA不着色。
派洛宁:RNA和低聚DNA染红色,与甲基绿联用可区分核酸聚合状态。
不同染料的颜色差异与其化学结构及核酸结合方式密切相关,选择时需兼顾灵敏度、安全性和实验需求。