目前针对木薯淀粉中植物源性成分（包括核酸）的鉴定，可采用多重实时聚合酶链式反应（real-time PCR）技术。该方法通过分析物种基因差异（如木薯g3pdh基因序列）进行特异性检测，具有高通量、结果准确且不受加工工艺影响的特点。具体流程包括：
1. DNA提取：优先选用深加工食品专用试剂盒，确保模板DNA纯度（OD260nm/OD280nm及OD260nm/OD230nm符合要求）。
2. 引物探针设计：针对木薯特异性基因设计引物和TaqMan探针，通过序列比对验证可行性。
3. 多重PCR体系优化：通过波长选择和吸光度测定实现精准判定。
木薯淀粉的检测标准涵盖理化、卫生及分类要求：
1. 理化指标：水分≤15.0%、灰分≤0.6%、酸度≤10.0mL等，需按GB/T 29343-2012执行。
2. 卫生标准：菌落总数≤100000CFU/g，重金属、农残等需符合GB 5009.12等引用标准。
3. 分类定义：2023年修订草案将木薯淀粉分为普通型与蜡质型（直链淀粉含量≤5%）。
国家抽检数据显示，菌落总数超标是主要不合格原因（占比41.1%），2025年实施的GB 31637-2025将优化微生物检测方法。对于核酸阳性案例，建议结合多重PCR法与理化指标综合判定，以排除交叉污染或原料掺假风险。
